考查用益物权。承包经营合同是确认土地承包经营权的主要依据。选项A说法正确。土地承包经营权的主体是公民或集体组织。土地承包经营权的客体为全民所有的土地和集体所有的土地。选项B说法不正确。土地承包经营权人权利的保护方法既包括物权的方法，也包括债权的方法。选项C说法正确。宅基地使用权的主体是公民，而且主要为农村集体经济组织的成员，是农民基于集体成员身份而享有的福利保障。宅基地使用权的客体主要是集体所有的用于建造住宅及其附属设施的土地。选项D说法不正确。宅基地使用权必须遵循法定的申请程序，经过有关部门的批准后方可取得。选项E说法正确。本题答案为ACE。