A选项错误，采用新设备的方案，投资按8万元计算。
B选项正确，在进行设备更新方案比选时，原设备的价值（投资）应按目前的实际价值3万元计算，不考虑其沉没成本。
C选项错误，新旧设备现在的市场价值差额为8-3=5万元。
D选项正确，该决策中旧设备产生的沉没成本=账面价值（4万元）-当前市场价值（3万元）=1万元，不考虑其沉没成本。
E选项错误，新设备和旧设备的经济寿命和运行成本不相同。
综上，本题应选BD。