A选项说法正确，设备的自然寿命不能成为设备更新的主要决策依据。
B选项说法错误，做好设备维修和保养可延长设备的自然寿命，但不能从根本上避免设备的有形磨损，任何设备磨损到一定程度时，都必须进行更新。
C选项说法正确，经济寿命是从经济角度衡量设备最合理的使用年限，由有形磨损和无形磨损共同决定。
D选项说法错误，设备的技术寿命主要是由设备的无形磨损决定的。
E选项说法正确，设备的自然寿命主要是由设备的有形磨损决定的。
综上，本题应选BD。