本题考查药品经营质量管理规范。①药品追溯管理与实施、发票内容与付款流向不一致属于药品批发企业和药品零售企业共有的严重缺陷项目。②未配备计算机系统软件与数据库属于批发企业严重缺陷项目。③仓库未配备冷藏药品专用储存设备属于零售企业严重缺陷项目。④经营范围包含体外诊断试剂（药品）的企业的质量管理部门未配备主管检验师属于批发企业严重缺陷项目。故本题的正确答案为AC。