细菌的合成代谢产物包括毒素、色素、抗生素、侵袭性酶类等。毒素分为内毒素和外毒素。①内毒素是革兰氏阴性菌细胞壁中的脂多糖，菌体死亡或裂解后才能释放出来；②外毒素是革兰氏阳性菌和少数革兰氏阴性菌产生的一类蛋白质，在代谢过程中分泌到菌体外，毒性极强；③色素是某些细菌在代谢过程中产生的，具有不同的颜色，对细菌的鉴别具有一定的意义；④抗生素是某些微生物在代谢过程中产生的一种能抑制和杀灭其他微生物或肿瘤细胞的物质；⑤侵袭性酶类包括透明质酸酶、卵磷脂酶、链激酶等，其促使细菌扩散，增强病原菌的侵袭力。