药物与机体内功能蛋白相互作用而改变其构象或结构时可导致蛋白功能受到损伤。如长春碱（或紫杉醇）与微管蛋白结合，影响细胞骨架蛋白聚合或解聚。机体内源性靶点分子包括受体、酶、DNA、大分子蛋白、脂质等，长春碱（或紫杉醇）与微管蛋白结合产生毒性，属于药物直接与靶点分子作用产生毒性。故本题的正确答案为A。