对酸性、碱性或两性有机化合物来说，常可通过加入酸、碱以调节溶液的pH,改变分子的存在状态（游离型或解离型)，从而改变溶解度而实现分离。例如，一些生物碱类在用酸性水从药材中提出后，加碱调至碱性即可从水中沉淀析出称为酸提碱沉法（酸/碱法)。提取黄酮、蒽醌类酚酸性成分时采用氢氧化钙提取，加酸中和使其沉淀出来达到分离的目的称为碱提酸沉法。一些多肽和氨基酸化合物采用调节pH至等电，点使蛋白质沉淀的方法等也均属于这一类分离原理。