马胃蝇属完全变态，每年完成1个生活周期。以肠胃蝇为例：雌虫产卵在马的背部、胸、腹及腿部被毛上，一生产卵700枚左右。卵多粘在毛的上半部，每根毛上附卵1枚，约经5d形成幼虫；幼虫在外力作用下（摩擦、啃咬等）逸出，在皮肤上爬行，马啃咬时食入第1期幼虫，在口腔黏膜下或舌的表层组织内寄生约1个月左右，蜕化为第2期幼虫并移入胃内，发育为第3期幼虫。到翌年春季幼虫发育成熟，随粪便排至外界落入土中化蛹，蛹期1~2个月，后羽化为成蝇。成蝇活动季节多在5~9月份，以8~9月最盛。干旱、炎热的气候和管理不良以及马匹消瘦等有利于本病流行。多雨，阴天不利于马胃蝇发育。