结肠小袋虫寄生于猪主要是结肠，表现为肠炎症状；（1）包囊内有滋养体；（2）急性型（幼猪）主要表现为水样腹泻，混有血液；（3）慢性型最特征的病变在肺、淋巴结和肝。全身淋巴结髓样肿大，灰白色，切面湿润，尤以肠系膜淋巴结最为显著，呈绳索状，切面外翻，多数有针尖到米粒大、灰白色或灰黄色坏死灶及各种大小出血点。诊断：粪便检查，急性型病例，粪便中常有大量的能运动的滋养体；慢性型病例，粪中以包囊为主，尸体剖检可刮取肠黏膜作涂片检查。治疗可试用呋喃唑酮、甲硝唑（灭滴灵）。