选项A当选，具体计算过程如下：
（1）国内运输收入应按“交通运输服务”计算缴纳增值税，税率为9%；具有国际运输经营资质的纳税人取得的国际运输收入，适用增值税零税率；飞机清洗消毒收入应按“物流辅助服务——航空服务”计算缴纳增值税，税率为6%。
（2）购进飞机配件取得了增值税专用发票，其进项税额可以抵扣。
综上，该公司9月应缴纳增值税=1387.5÷（1+9%）×9%+127.2÷（1+6%）×6%-84.5=37.26（万元）。
选项B不当选，误将飞机清洗消毒收入按照9%税率计算销项税额。
选项C不当选，误将国际运输收入按照9%税率计算销项税额。
选项D不当选，误将飞机清洗消毒收入和国际运输收入都按照9%税率计算销项税额。