深化预算管理制度改革的主要内容有：①加大预算收入统筹力度，增强财政保障能力；②规范预算支出管理，推进财政支出标准化；③严格预算编制管理，增强财政预算完整性；④强化预算执行和绩效管理，增强预算约束力；⑤加强风险防控，增强财政可持续性；⑥增强财政透明度，提高预算管理信息化水平。