真皮中的结缔组织，尤其是含量最多的胶原纤维失去了在常规染色中所见的红色色泽，代之嗜碱性变以及混浊肿胀，乃至断裂。这种病变可能是由于免疫复合物造成损伤的结果。在系统性红斑狼疮中的免疫复合物则是多种核抗原及相应抗核抗体所组成。在常规染色切片中可见到在肿胀碎裂的纤维上和纤维问，有深红色蜡样物质沉积。沉积物可被过碘酸锡夫氏(PAS)反应呈强阳性，文姬萨(VanGieSon)染色呈黄色。在纤维蛋白样沉积物区域，基质量常常增加，尤其是透明质酸。因此阿新蓝染色呈强阳性反应，甲基胺蓝呈异染性。