根据《建筑业企业资质管理规定》，从事土木工程、建筑工程、线路管道设备安装工程的新建、扩建、改建等施工活动的企业，应当按照其拥有的资产、主要人员、已完成的工程业绩和技术装备等条件申请建筑业企业资质，经审查合格，取得建筑业企业资质证书后，方可在资质许可的范围内从事建筑施工活动。选项A正确。企业可以申请一项或多项建筑业企业资质。企业首次申请或增项申请资质，应当申请较低等级资质。选项B和选项C正确。施工总承包资质序列中特级资质、一级资质及铁路工程施工总承包二级资质，由国务院住房城乡建设主管部门许可。选项D错误。具有法人资格的企业可直接申请矿山工程施工总承包二级资质。选项E正确。因此，答案为A、B、C、E。