植物新品种权的权利限制包括合理使用和强制许可授权品种。植物新品种权的合理使用是指利用授权品种进行育种及其他科研活动或者农民自繁自用授权品种的繁殖材料，可以不经品种权人许可使用授权品种，并不向其支付使用费。但是，利用授权品种进行育种及其他科研活动，农民自繁自用授权品种的繁殖材料等，不得侵犯品种权人享有的其他权利。《植物新品种保护条例》第十一条规定：“为了国家利益或者公共利益，审批机关可以作出实施植物新品种强制许可的决定，并予以登记和公告。取得实施强制许可的单位或者个人应当付给品种权人合理的使用费，其数额由双方商定；双方不能达成协议的，由审批机关裁决。”