粪便的消毒有焚烧法、掩埋法、化学消毒法及生物热消毒法，其中生物热消毒法是对粪便经济有效的消毒方法，所以粪便的消毒多采用此法。湿粪堆积发酵所产生的生物热可达70℃或更高，能杀灭一切不形成芽孢的病原微生物和寄生虫卵。用这种方法处理后的粪便由于发酵腐熟快、肥效良好。