青蒿素是从植物黄花蒿茎叶中提取的有过氧基团的倍半萜内酯抗疟药物，其特征在于含有一个内过氧化物-缩酮-乙缩醛-内酯的结构。青蒿素的构效关系研究表明：结构中内过氧化物对活性存在是必需的，如双氧桥被还原为单氧成为脱氧青蒿素，会完全失去抗疟活性。只有过氧键还不能产生足够的抗疟活性，本品的抗疟活性更应归于内过氧化物-缩酮-乙缩醛-内酯的结构。经进一步的研究认为疏水基团的存在和过氧键的位置对其活性也至关重要。如在其分子中引入亲水性基团或使其极性增大，则导致抗疟活性减少。为保持和增加抗疟活性，其亲脂性是非常重要的。