白塞综合征的组织病理学早期表现为白细胞碎裂性血管炎，管腔变窄、闭塞，血栓形成，管壁有纤维蛋白样变性坏死，管壁及周围组织有中性粒细胞浸润及白细胞碎裂；后期可表现大量淋巴细胞及浆细胞浸润，常累及毛细血管、细小静脉，小静脉，少数细小动脉也可累及，结节损害血管周围呈淋巴细胞浸润。