上皮样肉瘤的组织病理学特点为纤维组织间有不规则结节状瘤细胞团，中央坏死，坏死周边的瘤细胞呈栅栏状排列。瘤细胞有两型：一种细胞为上皮样细胞，占大多数，呈多边形，胞质丰富，嗜伊红性。另一种细胞为梭形细胞，呈长梭形，在瘤细胞团中呈旋涡状排列。细胞核异型性明显，但罕见双核或奇形核细胞。两种细胞间有移行细胞。瘤细胞间和瘤细胞团周围常见淋巴细胞浸润。瘤细胞也可浸润内脏和周围神经。免疫组织化学染色：90%以上的病例波形蛋白、细胞角蛋白和EMA阳性，近60%的患者CD34阳性。SMA也常局灶阳性。波形蛋白、CD34和角蛋白同时阳性对上皮样肉瘤的诊断很有帮助。