颈部疾病中与先天胚胎发育有关的包括：颏下皮样囊肿、甲状腺舌管囊肿、囊状淋巴管瘤和胸腺咽管囊肿。结节性甲状腺肿是单纯性甲状腺肿的一种，多由弥漫性甲状腺肿演变而成，属于单纯性甲状腺肿。病因主要有以下几个方面：①缺碘；②致甲状腺肿物质；③激素合成障碍；④高碘；⑤基因突变。故答案应选D。