由自身免疫机制所致慢性萎缩性胃炎，自身免疫性胃炎的萎缩性改变主要位于胃体部。患者体内产生针对胃组织不同组分的自身抗体。如抗内因子抗体（致维生素B12吸收障碍）、抗胃壁细胞抗体（破坏分泌胃酸的胃壁细胞）、抗胃泌素分泌细胞（致胃泌素分泌障碍）等，造成相应组织破坏或功能障碍。