内部招募在某些情况下也会出现一些问题。这主要表现在：首先，职位空缺的出现可能会导致员工之间过度竞争。同时，那些同样提出了申请但却没能够得到新职位的员工可能会感到不满或者不公平。其次，内部招募的做法容易形成所谓的"近亲繁殖"现象，久而久之导致组织内部员工的知识、技能、经验同质化，工作效率下降，严重时甚至会形成一种论资排辈的官僚主义文化。