净制的主要目的如下：①除去泥沙杂质及虫蛀霉变品；②进行大小分档，便于进一步软化、切制和炮炙，使其均匀一致；③分离不同药用部位，使不同药用部位各自发挥更好药效，如麻黄根和麻黄茎；④除去非药用部位，保证用药剂量准确或减少服用时的副作用，如去粗皮、去核等。