原发性精索静脉曲张左侧明显高于右侧的原因包括：左侧精索静脉比右侧长8～10cm；左侧精索静脉压大于右侧；左精索内静脉呈直角注入左肾静脉；左肾静脉通过主动脉和肠系膜上动脉之间；左精索内静脉下段位于乙状结肠后面等。这些解剖结构使左精索内静脉容易受压，并增加静脉回流阻力。因此答案选E。