巴贝斯虫在红细胞内繁殖，破坏红细胞，导致溶血性贫血，并引起黄疸。虫体本身具有酶的作用，使动物血液中出现大量的扩血管活性物质，如激肽释放酶、血管活性肽等，引起低血压休克综合征。虫体可以激活动物的凝血系统，导致血管扩张、淤血，从而引起系统组织器官缺氧，损伤器官。临诊上，本病多呈慢性经过。病初犬精神沉郁，喜卧，四肢无力，身躯摇摆，发热，呈不规则间歇热，体温在40～41℃，食欲减退或废绝，营养不良，明显消瘦。结膜苍白，黄染。常见有化脓性结膜炎。从口、鼻流出具有不良气味的液体。尿呈黄色至暗褐色，少数有血红蛋白尿。粪往往混有血液。部分病犬呕吐。