猪水疱病一般根据临诊症状和病变可以初步诊断，但无法与口蹄疫、猪水疱性口炎等疫病相鉴别，必须进行实验室诊断。其中动物接种是主要方法。方法是将病料分别接种1~2日龄和7~9日龄小鼠，如2组小鼠均死亡者为口蹄疫；1~2日龄小鼠死亡，7~9日龄小鼠不死者，是猪水疱病。因此，常用于诊断猪水疱病的实验动物是小鼠。