临床上主要是通过传统的脑脊液抗酸杆菌涂片和培养两种方法来进行检查的，并作为结脑确诊的金标准。涂片法具有简便快速和价廉优点，但存在阳性率低（10%）、特异性差和无法区别死菌还是活菌等缺陷。培养法的阳性率仍低（20%~30%），由于需时较长（4~8周）而失去早期诊断的价值。