医院感染监测可分为全面综合性监测和目标监测两类。全面综合性监测是对所有住院患者及医务人员的医院感染及其相关因素（危险因素）进行连续地监测，以了解全院发生医院感染的情况，以及各科室的感染发生率、部位发生率、抗菌药物使用情况、各种危险因素、消毒灭菌效果和医务人员的不良习惯等，从而进行针对性的管理及预防。