氨中毒学说认为肝性脑病的主要发病机制是氨导致脑的能量代谢紊乱。肝脏功能正常时，可将氨转变为尿素和谷氨酰胺排出体外，使之极少进入血液。肝脏病变时，肝脏对氨的代谢能力减退，血氨增高。游离的NH3有毒性，且能透过血脑屏障，影响大脑的能量代谢，引起肝性脑病。