破碎细菌细胞作用常用的方法是酶处理法、SDS处理等，少用冻融法。破碎细胞的方法有机械法（研磨、压榨等）；物理法（反复冻融法、急热骤冷法、超声波处理）；化学及生物化学法（自溶法、酶溶法）；化学渗透法。但冻融法用于组织细胞，多用于动物性材料，对微生物细胞作用较差。