大便常规及培养，1/d，3次，停药后再2次。并作药敏试验。必要时以PCR法查大便志贺菌。大便镜检注意原虫(阿米巴原虫、隐孢子虫)、肠滴虫、各种寄生虫虫卵、霉菌菌丝。各种肠毒素测定。如大肠埃希菌肠毒素(LT、ST)，难辨梭状芽胞杆菌毒素。厌氧菌培养(空肠弯曲菌、难辨梭菌)。电镜查病毒颗粒、核酸电泳图谱(PAGE)。