细菌素是某些菌株产生的一类具有抗菌作用的蛋白质。细菌素具有种和型的特异性，可用于细菌分型和流行病学调查。热原质是细菌合成的一种注入人体或动物体内能引起发热反应的物质。某些细菌可产生毒素和侵袭性酶类，是细菌重要的致病物质。某些细菌可产生不同颜色的色素，有助于细菌的鉴别。