门静脉血流受阻后，首先出现充血性脾大。门静脉高压症典型病理生理变化包括脾大、脾亢，静脉交通支扩张，腹水。脾窦扩张，脾内纤维组织增生，单核-吞噬细胞增生和吞噬红细胞现象。临床上除有脾大外，还有外周血细胞计数减少，最常见的是白细胞和血小板计数减少，称为脾功能亢进。由于肝内门静脉通路受阻，门静脉无静脉瓣，门静脉系和腔静脉系间的4个交通支（胃底、食管下段交通支、直肠下端-肛管交通支、前腹壁交通支和腹膜后交通支）大量开放，扩张，引起消化器官淤血。门静脉压力升高，使门静脉系统毛细血管床的滤过压增加，同时肝硬化引起低蛋白血症，血浆胶体渗透压下降和淋巴液生成增多，促使液体从肝表面、肠浆膜面漏入腹腔形成腹水。