疫源地消毒的主要目的是切断传播途径，因此此种消毒方式控制肠道传染病的效果要优于呼吸道传染病，因为病原体可随同排泄物（粪、尿）、呕吐物一起排出，能及时发现并迅速进行处理。此外，病原体在侵入新的个体前均在外界环境中存留一定时间，故正确进行消毒可及时消灭病原体，有效地防止向周围环境的播散，切断传播途径。