医院消毒的目的是切断医院感染的传播途径以达到预防和控制内源性感染和外源性感染的发生。医院感染主要是通过侵入性操作、污染物品的接触、空气传播、水、医务人员手等途径传播，因此医院消毒主要是针对这些方面的消毒，将病原微生物消灭于外环境，从而保护病人免受其感染。