微波可以杀灭各种微生物，包括细菌繁殖体、真菌、病毒和细菌芽胞等。适合于能吸收微波较多的物品的消毒，如水、肉类和含水分较多的物品等。吸收微波较少的物品如金属、塑料、陶瓷等原则上不适合用微波消毒，如要消毒需用湿布包裹后再用微波处理。怕湿、热的物品不能用微波消毒。