酸雨的危害引起呼吸道刺激并发生慢性炎症，特别对婴幼儿影响更大。土壤酸化可使重金属在土壤中溶解性增加，加速有毒金属进入农作物而使人体摄入增加。水体酸化使水生生物生长受到影响，鱼群减少，水生植物也受到影响，并影响水体自净。酸雨还能腐蚀建筑物，破坏输水管网，使水质恶化。