乙肝病毒有3对抗原抗体系统，即HBsAg与抗-HBs、HBcAg与抗-HBc、HBeAg与抗-HBe。其中HBeAg阳性提示病毒在复制，是传染性强的标志。抗-HBe阳性提示复制减少，传染性下降。HBsAg是感染的主要指标，其本身无传染性，也不反映病毒复制的程度。抗-HBs为保护性抗体，阳性为恢复的标志。HBcAg主要存在于受感染的肝细胞核内，难以检测。