实验室病原体培养是确诊感染性角膜溃疡的重要检查技术，棘阿米巴培养需使用特殊的大肠杆菌覆盖的非营养性琼脂培养基，30～37℃培养3～4天即可见棘阿米巴生长，应培养4～6周，培养阳性时可镜检。而其他选项中的血琼脂培养基、巧克力培养基、马铃薯葡萄糖琼脂培养基和Sabouraud培养基等均为真菌培养基。因此本题的正确答案是E。