雷公藤毒性较大，对机体多个器官和系统均呈现毒副作用，消化系统可见恶心呕吐、腹胀腹泻及便秘便血等；神经系统可见头晕、乏力、嗜睡等；血液系统可见白细胞及血小板减少等；生殖系统可使男性不育，女性月经紊乱或闭经等；心血管系统可见心悸、胸闷甚至引起心律失常，心源性休克等；少数病人出现肾功能损害，甚至急性肾功能衰竭而死亡等。