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胸、腹开放性损伤超过4小时或血液在体腔中留存过久者是自体输血的禁忌症，胸腔开放性损伤血液受到污染，结肠瘤肝转移中可能有肿瘤细胞玷污，腹部闭合性损伤致肝破裂血液受胆汁消化液污染，骨盆骨折合并膀胱破裂血液受到尿液污染均不能进行自体回输。